柯文哲曾多次批評中國國民黨，曾表示與民主進步黨有共同的戰略目標，就是「臺灣人要做臺灣這片土地的主人」。 1994年民進黨籍的陳水扁選臺北市市長時，柯文哲為扁醫界後援會幹部。 2000年，柯文哲擔任陳水扁競選總統臺大醫院後援會召集人。 2012年4月，柯文哲參與凱達格蘭學校當學生。 2012年6月，柯文哲等醫界人士組成陳水扁民間醫療小組，並由柯文哲擔任召集人，該小組判定陳水扁身體狀況不佳並發起連署，希望法務部能讓扁保外就醫。 2017年9月30日，由於柯文哲在TVBS《少康戰情室》接受趙少康專訪時稱「他（陳水扁）一開始是裝的，後來變成真的病」，因而被陳水扁民間醫療小組免除召集人一職，而且此番言論遭到民眾檢舉。
2013年5月1日，柯文哲收到法務部調查局臺北市調查處公函，將他列為大專院校教授涉挪用國科會補助款弊案的犯罪嫌疑人。 5月10日，柯文哲前往臺北市調查處接受約談，在約談中他表示有三個國科會研究計畫，許多項目混合，但發票與報帳是由助理處理，並非由他負責。 在約談後，檢方並未起訴柯文哲，柯文哲對約談舉動不滿，認為是司法選擇性辦案，國科會補助弊案是制度設計錯誤使然。 因對公立大學教授是否為「公務員保險法」、「國家賠償法」、「貪污治罪條例」上所稱的「授權公務員」，輿論看法不一，最高法院也未做出統一見解。 最高檢在2014年10月3日針適用對象除了教授涉詐國科會補助款、還包括MG149帳戶等執行3項國科會研究計畫，總長裁示公立大學教授不具《刑法》的公務員身分，不依貪污罪偵辦。 2013年6月，柯的學生臺大醫院急診部主治醫師曾御慈遭一酒駕闖紅燈的汽車業務員詹震山撞擊，送至亞東醫院，柯文哲雖至該院指揮急救，但最終仍宣告不治。
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2015年7月21日，柯文哲表示有三項凶案的凶手都是很孤立的「宅男」和社會孤立份子，社會安全網無法把他們找出來做追蹤，是社會安全網的破洞，受批評後於翌日改口稱「社會孤離、疏離份子」。 2015年1月15日，柯文哲聲稱：“社子島不開發，每人發300萬”，以此来表示對社子島開發案的不滿。 可達鴨是日本跨媒體製作的作品《精靈寶可夢》系列中一種虛構的鴨型怪獸，部份網友認為牠的外型與柯文哲相似，林昶佐、郝龍斌等人也曾以此消遣柯文哲，但柯文哲本人表示不像。 柯文哲競選辦公室發言人林昆鋒指出，早在2015年柯文哲已提過「兩岸一家親」的概念，且柯文哲的「兩岸一家親」定義非指政治狀態。 柯文哲也表明「兩岸一家親不涉及政治」，其初衷是希望兩岸彼此諒解，因此柯文哲也提出「五個互相」原則（即一五新觀點），爭取順利舉辦大型賽會，並促成蔡英文以中華民國總統身份在臺北世大運上台講話。 11月10日，選前19天，又公布8月1日起至10月31日的第二波競選經費，同時為了遵守競選經費控制在新臺幣8,000萬元的承諾，宣布停止對外募款，並在11月15日關閉小額捐款帳戶。
Facebook群組裡亦有人收到「懷疑診所代表」私訊要求刪除相關貼文。 到最近，事主再次因為沒有選擇的情況下帶女兒到該診所求診。 事主指當天醫生並沒有按時開診，令她在醫務所白白等了一小時才開始輪症。 當時診所護士亦沒有如實把輪診人數告訴事主，輪診安排混亂。
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事主表示五年前曾經因為「見紅作小產」而到該醫務所求診，但當時醫生懷疑把婦產科用具「鴨嘴挾」錯誤調轉使用，引致事主子宮大量出血，胎兒險些不保。 事主最後需要轉到急症室求診，並卧床休息一星期才保住胎兒。 他提到，若要求醫生在專科培訓前，留在公營系統服務，能讓他們對整體醫學知識上有幫助，相信對將來的基層醫療發展都有好處，而在專科培訓後才在公營系統服務，對醫生的培訓有益處。 對於當局考慮規定醫護人員 ，在公營醫院服務一定年期，梁嘉傑說，特別註冊的醫生，目前需要在公營醫療機構服務至少5年，相信當局會考慮相關因素。
「在中環開診，服務是否妥貼好重要，如果病人滿意，醫生的口碑就會在病人的network口耳相傳，才會有更多人幫襯。」有中環名醫說。 名醫的病人非富則貴，除了診症準、手勢好，對病人是否細心亦很重要。 曾是「賭王」主診醫生的腦科醫生謝勝生，雖然診所設在萬邦行對面的連卡佛大廈內，但病人一樣絡繹不絕，部分人更要在門外走廊等候。 與中建大廈一街之隔的「皇后大道中九號」，乃新晉名醫大廈，坊間被稱為頂級診所的「仁德醫療中心」正落戶於此，仁德在九五年由霍英東三公子霍文遜成立。 「能夠在『813』或仁德插旗的，都是名醫。」有行內人士稱。 至於名醫界樓王，非有「富豪御醫」之稱的心臟科醫生謝德富莫屬。
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據醫管局資料顯示，過去一年有二百多名醫生離職，三成是年資逾十年的資深醫生；全港七大醫院聯網無一倖免，而作為港大教學醫院的瑪麗醫院，更是重災區之一，多名港大教授級醫生，紛紛開檔搵真銀。 青山醫院最近已有四名資深醫生離職，其中三人到中環開檔，包括他自己。 「日後青山醫院點做，要看管理層了。」他無奈地說。 「以前在公立醫院的病人，未必有能力出來睇私家了，在中環一定是target on中產階層。」曾繁光說。 據了解，自從他「棄公投私」的消息傳開後，幾十名病人先後致電查詢，並已有兩名病人預約，足見名醫有幾渴市。
其後，病人因劇烈腹痛及嘔吐，數次到醫院急症室求診，病人亦向女兒透露腹部位置感覺「實實哋，同其他皮膚不一樣」。 至2016年7月期間，病人多次到朱建華診所求診，並向朱建華表示有腹痛問題，檢查後朱建華均指未察覺異樣，只為其處方抗生素治療。 何有為醫生 從〈醫護信箱〉提問後，更有機會參與〈醫訪共融計畫〉透過綜合意見問診服務，會員可對病情預先稍作了解後，選擇性地邀請相關合適醫生共同參與該計畫，為健康生活作更週全之護理安排。
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柯文哲確定勝選後發表當選感言，他說：「造就臺北改變成真的力量，來自於庶民、鄉民和公民。我來自庶民，未來進入臺北市政府會繼續傾聽庶民的聲音。」並再度承諾，在他執政任內公務員不必服務政治與政黨，只需要全心全力服務臺北市民。 何有為醫生 柯文哲在2014年1月6日表態參選臺北市市長，並在座談會中表示，臺大醫院失誤移植愛滋病患器官案是決定參選的主因。 1月16日，成立競選辦公室，啟動青年海選計畫，徵求工作人員和志工等。
中學畢業考取臺灣大學醫學系，因父臥病至家境陷入困境，且兄已在臺大醫學系就讀，故以公費就讀新竹師範專科學校。 屆齡申請退休，至南太平洋馬紹爾群島擔任1年水電方面的監工，以負擔子女學費。 回臺後在新竹科學園區任管理人員，因精通日文成為日系企業的顧問，家境好轉，現仍擔任新竹科學園區內3家日系企業的顧問。 因其祖父在228事件的遭遇，在柯文哲對外宣稱可能參選臺北市長後，柯承發曾堅決反對他踏入政治。
何有為醫生: 註冊專科分類
他也曾在議會被杯葛時帶《金剛經》到議會內讀誦，此舉被揭露後，議員應曉薇質問柯文哲讀經心得。 柯文哲接話，開始背誦經文，應曉薇也跟著接力「過去心不可得、現在心不可得、未來心不可得」，柯文哲又再接下去，兩人在議場上念起經文，互別苗頭。 最後應曉薇送給柯文哲一本南懷瑾的著作《金剛經說甚麼》。 朋友大力介紹呢個女婦產科醫生俾我, 何有為醫生 因為我自己想見女醫生. 初初睇覺得佢有D cool, 說的話不多, 但都覺得佢有經驗同細心的. 今日好想同各位住將軍澳的媽媽分享一件不公平的事，亦希望各位媽媽去看這位醫生前三思⋯話說五年前，二女芳.
謝德富在九○年曾與「富豪飯堂」福臨門的兩兄弟徐鈞沛和徐維均合作開公司，並一同擔任董事，可見謝德富不止在醫學界吃得開，與城中名人家族亦十分老友。 港大腸胃學講座教授王振宇，更早過這批同事，今年六月率先進駐中建，加入「中環名醫」行列。 王振宇是研究幽門螺旋菌和胃酸倒流的專家，他在大學教書時，花了十五年研究胃癌與幽門螺旋菌的關係，更發現長期服用阿士匹靈有效減低患胃癌的風險，○八年獲國家科學技術進步獎一等獎，近年則專研胃酸倒流。 據了解，像廖子良般級數的外科醫生，在中環開診「最好搵」，皆因手術費不菲，閒閒哋盛惠幾十萬，因此不少港大外科教授都自己開檔搵錢。
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記者還多次致電遼寧中醫藥大學附屬醫院及其脾胃科，醫院電話始終未有人接聽。 2006年7月15日，柯文哲於《民生報》撰文 何有為醫生 《反省、認錯、道歉 談趙建銘案》，自此受媒體注意，有時訪問他對政治事件的看法。 11月18日，臺中市市長胡志強妻子邵曉鈴在為中國國民黨高雄市長參選人黃俊英輔選行程中，因廂型車車禍陷入深度昏迷，柯文哲建議為邵曉鈴安裝葉克膜，並立刻指派臺大急救小組安裝葉克膜，使邵曉鈴存活率提高，最終得以治療康復。
於臺大醫院擔任「急診」與「重症加護」工作11年後，為研究器官移植，決定赴美進修。 1993年，至美國明尼蘇達大學醫學院外科進修1年，研究「人工肝臟」。 1994年返臺，回到急診室工作，同時進入臺灣大學醫學研究所博士班。 經臺大醫院外科主任朱樹勳指派，柯文哲建立起臺大器官移植小組，並以心臟移植為目標。 為增加移植成功率，柯文哲率先從美國引進葉克膜技術。 其所負責的創傷急救團隊，將病患存活率從19%提高到51%，並曾於2008年1月30日創下讓病患連續使用葉克膜117天再移除，成功復原的世界紀錄。
何有為醫生: 何有為醫生
後來決定以無黨籍身份參選，與獲得民進黨第一階段初選出線的姚文智舉行3場辯論，進行在野整合。 6月16日，民進黨同意不推出候選人，由柯文哲代表在野聯盟競選。 何有為醫生 選舉期間曾參訪日本東京、大阪，美國紐約和舊金山。
- 事主當時立即問醫生「係咪唔應該用電筒照小朋友對眼令佢開口？」，怎料醫生以惡劣態度指：「如果質疑佢嘅專業可以唔睇！」。
- 他認為，疫情後期間，未必吸引到非本地培訓醫生在港執業，相信在疫情後申請人數會增加。
- 梁子駿於2015年4月28日最後一次在瑪麗醫院覆診，及後因搬到康橋之家，遂轉至葵涌醫院覆診。
- 一切有為法 如夢幻泡影 如露亦如電 應作如是觀 欲知前世因 今生受的是 欲知來世果 今生作的是 大千世界 無罣無礙 …
- 於臺大醫院擔任「急診」與「重症加護」工作11年後，為研究器官移植，決定赴美進修。
- 事主指當時醫生只「隨便檢查一下」就完成診症。
梁子駿（終年14歲）於2016年8月23日下午不治，案發地點為位於葵涌禾塘嘴街的康橋之家。 何松由2012年至梁子駿入住康橋之家前，一直是其主診醫生，有為他處方藥物，並評定他患中度智障及自閉症。 他指出，有紀錄顯示梁子駿的哥哥疑被父親虐待；及後梁子駿亦疑同被虐待，故於2014年7至8月兩度入住東區醫院兒科接受調查，及後被安排入住屯門某照顧中心。
何有為醫生: 家庭
他又表示，男生表達能力有限，從未從他口中得悉有自殺傾向。 何有為醫生 提供各醫生的診所地址、聯絡方法、應診時間和專業資格等資訊供市民參閱，以便大家能夠選擇自己所需的專科醫生。 《醫生與你》以多角度、全方位讓觀眾認識各類疾病的病徵、病理根源、醫治方案以及預防方法等，務求令觀眾可以對各種疾病有更深了解，以減輕對疾病的擔憂及恐懼。
何有為醫生: 醫生涉誤殺受關注 凸顯病人權益重要
同年12月13日，臺北地方法院公布重新計票的結果，丁守中仍輸柯文哲3,567票，相較於11月25日的開票結果多輸了313票。 2014年9月10日，柯文哲陣營在選前80天公布第一波競選經費，包括募款收入和競選支出，並表示當選市長後也會要求市府各局處上網公告開會紀錄與經費。 9月18日，在選前72天公布夫妻兩人18年（1995年到2013年）來的所得稅扣繳憑單和個人財產，以及MG149中葉克膜團隊（SICU）互助金帳號、存摺和所有私帳細目，以反擊連勝文陣營對MG149案的質疑。
何有為醫生: 註冊專科醫生/分類
至於治療方法，流感有特效藥「特敏福」，而RSV主要靠患者抵抗力，醫生或會處方一些紓緩病徵的藥物，如消炎藥、止咳藥等，亦有部份患者需要「聞氣」。 何有為1980年畢業於齊齊哈爾醫學院，師從多位中國婦科界知名專家，通過多年的行醫，積累了豐富的臨床經驗。 何有為曾在多家婦科雜誌上發表學術論文，針對防治女性陰道炎、宮頸糜爛提出自己的見解，何有為主張，治療婦科疾病，需要抓住根本的病因，針對病因早發現，早治療。 陳表情僵硬，只能擠出「俗稱belly button」等寥寥數語，以表示自己也懂肚臍的單字，場面極其尷尬。 因上海市委常委沙海林代表市長楊雄赴臺北參加「2016年臺北上海城市論壇」，其「統戰部長」身分引發外界質疑。 柯文哲表示，他「覺得還好」，臺灣民眾之所以反彈，係因兩岸「文化隔閡」。
何有為1980年畢業於齊齊哈爾醫學院，師從多位中國婦科界知名專家，通過多年的行醫，積累了豐富的臨牀經驗。 不少網民也留言分享類似經歷，有人指出肇事醫生診症隨便，甚至連醫院急症室的醫生也記得肇事診所的名字。 醫院醫生亦表示很多病人到肇事診所求診後都會令病情惡化，最後需要轉到急症室求助。 何有為醫生 亦有網民指肇事醫生「態度差」、「無耐性」、「無禮貌」，沒有選擇下才會向他求診。 直到正式面診，因為事主女兒不願張開口讓醫生檢查，醫生無視安全問題，用電筒照小朋友的眼睛，並示意小朋友張開口。
同年10月以後，由臺灣省行政長官公署教育處派任至新竹女子高等家政學校（現新竹市立建華國民中學）當校長。 民國36年228事件發生，柯文哲父親柯承發回憶當時柯世元將外省籍校長和同事帶到家裡保護，但清鄉時被軍隊抓去，拘禁將近一個月，其間遭毆打，返家後臥床3年多，後於1950年（民國39年），以54歲之齡病逝。 2003年（民國92年）8月2日，第十任中華民國總統陳水扁頒發「228回復名譽證書」給491位受難者及家屬，柯家是其中之一，證書長掛柯文哲辦公室牆上。 2014年5月29日成立個人YouTube頻道。 2019年7月31日，柯文哲完成台灣民眾黨創黨登記，於8月6日正式創黨，並出任首任黨主席；2022年12月10日，順利當選第二任黨主席。 同年12月25日，正式卸任臺北市市長的身分。