屯馬綫日常維修廠房是設於新界沙田區大圍與顯徑站之間，即港鐵現時大圍站西南面的大圍車廠及新界元朗區錦上路站與荃灣西站之間，即港鐵現時錦上路站南面的八鄉車廠，兩個車廠每日24小時運作，為屯馬綫的列車提供維修服務。 根據港鐵向立法會提交的2021年統計數字，2019年上半年屯門至紅磡段以每平方米六人站立密度計算的最高可載客量為5.6萬人次，而最繁忙的路段為錦上路站至荃灣西站，載客率以每平方米四人及六人站立密度計算分別為99%及84%，載客率為所有港鐵重鐵路綫中次高。 由輕鐵轉乘屯馬綫的乘客，請於轉乘屯馬綫前於出站收費器上確認，否則會扣除輕鐵最高車資及不可賺取輕鐵個人八達通積分，而轉乘優惠亦會自動失效；如乘搭輕鐵後在屯馬綫原站出入，當中的差額不會退回。 輕鐵免費轉乘優惠：必須於指定屯馬綫車站出閘後30分鐘內再於指定輕鐵站入站收費器確認，或於指定輕鐵站出站收費器確認後30分鐘內再於指定屯馬綫沿途各站入閘。 何文田站轉車 因應香港特區政府為防範2019冠狀病毒病疫情之應變措施，紅磡邊境管制站關閉，香港紅磡站暫停開放；東鐵綫來往金鐘至落馬洲的列車服務及屯馬綫的列車服務及維持正常，而城際直通車暫停服務。 2021年1月31日，紅磡站屯馬綫新建月台完工並交付車務部，至此所有工程完成，進入全面試營運階段。
- 雙方隔着打開的車門互罵、互擲水樽、雨傘等，有人取出金屬鎚子揮舞，隨後有示威者在車廂內取出滅火器施噴，造成列車內白煙瀰漫。
- 由於在慈雲山設車站有很大技術困難，以及未能克服安全問題，政府正研究增設其他行人設施及重整小巴服務，以完善區內交通及做好該區與沙中線的接駁。
- 綠色專線小巴$0.3轉乘優惠適用於所有港鐵站，輕鐵及機場快綫除外;指定綠色專線小巴、巴士及街渡渡輪之轉乘優惠適用於指定港鐵站。
- 政府在「我們未來的鐵路」第二階段公眾參與的咨詢文件中提出，建議屯馬綫由屯門站起向南延伸，到達屯門碼頭一帶，此段車程約需4分鐘，預計2030年落成。
- 車長發現入錯路軌後隨即煞停列車，其後將列車反方向倒車駛出約30公尺，待路軌修正後，列車才成功進入九龍灣站 。
- 2017年7月18日：因應清拆橫跨太子道東的K9高架道路，往觀塘方向的「采頤花園」站臨時遷移至太子工業大廈外。
- 有見及此，港鐵喺站裏面張貼通告指示去何文田邨及愛民邨嘅乘客可以喺B2出口附近搭小巴綫8M。
- 「自悠通」曾經有免費乘搭專線小巴81K線的優惠，於2005年2月1日生效，但已於2007年1月1日起取消。
2016年4月1日：來回程於迎禧路昇薈對面加設分站；往愛民邨方向，在東涌區內的八達通雙向分段收費亦改於該站生效及結束。 大嶼山北部對外巴士路線E21A，由城巴營辦，來往何文田（愛民邨）及東涌（逸東邨），途經旺角、深水埗、長沙灣、美孚、東涌北及東涌市中心。 九龍巴士（一九三三）有限公司，〈7B、8、17、18、41、45、109 永久新增及取消巴士站〉［乘客通告］，2016年10月。 城巴有限公司、新世界第一巴士服務有限公司，〈忠孝街佛光街後巴士站遷移〉［乘客通告］，2016年10月7日。
何文田站轉車: 車站列表
4月18日起，屯馬綫分6至8個晚上的非行車時間進行全綫列車測試，來回烏溪沙站與屯門站，自此西鐵綫及屯馬綫一期開始共用車隊營運。 何文田站轉車 5月2日，西鐵綫及屯馬綫一期當日的列車服務延遲至早上7時30分開始，以配合屯馬綫全綫大型列車測試，期間亦安排免費接駁巴士服務受影響的乘客。 何文田站轉車 測試最後比原定時間提早完成，西鐵綫及屯馬綫一期因此分别於早上約7時10分及早上6時40分回復正常。 同年2月14日，通車特別首班車於清晨約5時45分由啟德站開出，馬鞍山綫正式併入屯馬綫一期運作。
免費港鐵接駁服務包括羅湖站及落馬洲站，但不適用於輕鐵、港鐵巴士、港鐵接駁巴士)及東鐵綫頭等額外費。 如使用市區預辦登機服務，免費港鐵接駁服務只適用於前往市區預辦登機服務之前一程港鐵車程。 另一方面，屯馬綫全綫十分迂迴，往返新界東西兩端必須經過九龍，一般不會有乘客搭足全程。 雖然屯馬綫能為乘客提供更多轉綫選擇（例如轉乘東鐵綫由以往只能在大圍轉乘，變成可於該站或紅磡轉乘），部份車程可透過轉綫次數較少的方式往返，但並不代表所需時間因而減少。 事實上新界西來往沙田及馬鞍山，只須乘搭263（屯門）及269D（天水圍及元朗），在城門隧道轉車站轉乘40X、43X（大水坑至烏溪沙）、46X（大圍及顯徑）、47X（沙田圍及車公廟）及49X（第一城及石門），無論走線上及所需時間均比屯馬線更直接，更有優勢。
何文田站轉車: 沙田至中環綫
乘客若不熟悉路線運作安排，宜於上車時向司機問明是否途經所欲前往的目的地。 香港鐵路有限公司，〈港鐵屯馬綫將於二零二一年六月二十七日通車 鐵路網絡四通八達 出行更快更多選擇〉［新聞稿］，2021年5月28日。 縱使屯馬綫通車令西鐵綫及馬鞍山綫名稱消失，但因有關路綫名稱使用多時，不少人仍然會習慣稱呼其為西鐵或馬鐵，而部分人以地鐵稱呼沙田至 中環綫新建路段。 〈要求改善17號巴士線班次 – 九龍巴士（一九三三）有限公司回應〉，九龍城區議會交通及運輸委員會文件，2022年10月。 九龍巴士（一九三三）有限公司，〈九巴八條巴士路線總站遷往裕民坊新公共運輸交匯處〉［新聞稿］，2021年3月30日。 12歲以下小童優惠額折半計算；受惠於長者及合資格殘疾人士公共交通票價優惠計劃的乘客則第二程車費為以上第二程優惠車費（如為65歲或以上長者或12歲以下合資格殘疾人士則折半）與$2.0中的較低者，故或有部份轉乘組合變相失去轉乘優惠。
事後港鐵解釋，於今凌晨約2時45分，啟德站車站大堂近A出入口的天花附近，有一條鹹水管接駁位爆裂，有水從天花板空隙流落大堂，維修人員已即時關水掣及進行維修，車站亦安排人手清潔。 而港鐵亦曾於2016年10月15日開放車站予公眾參觀，在活動開始前約有200名市民排隊輪候進入車站。 而最終車站於同月23日隨觀塘綫延綫通車而正式啟用， 車站因「田」字而採用綠色為主調，而承建商為西松建設株式會社。 而兩鐵合併亦讓觀塘綫延綫項目獲得通過，興建何文田站的時候亦同步興建屯馬綫月台。 在沙中綫合併方案建議下，該站會發展為大型綜合轉車站，包括上下兩層的月台，分別供沙中綫與觀塘綫列車停靠，兩層月台呈十字型交叉。 何文田站轉車 何文田站公共運輸交匯處連接何文田站U2層，並設有巴士站、小巴站、的士站及上落客區等設施，可經B2出口前往。
何文田站轉車: 觀塘綫延綫通車
大部份港鐵站內的大堂都設有街道圖，指示出港鐵站鄰近的酒店、文娛設施、購物中心、主要大廈及其最近港鐵站出入口。 項目第二期地盤可建樓面最高達63.93萬平方呎，提供900至1,000伙單位，預期2024年落成。 項目在2018年9月17日共收到31份意向書，到同年10月22日截標，合共收到8份標書、包括長實、新地、恆地、嘉里建設、高銀集團、華懋、中國海外夥拍信置和會德豐夥拍新世界以合資形式競投。 一日後，港鐵公佈華懋集團成員旗下堡雅有限公司成功投得項目，項目於2022年8月8日正式命名為瑜一 ，由兩幢住宅大樓組成，合共提供844個單位，預計關鍵日期為2024年7月。 茘景站大堂分為上下兩部分，兩者以三條樓梯連接，當中兩條位於收費區內，餘下則一條位於非收費區，另亦有一條斜道連接。
另外由於愛民邨起喺忠孝街嘅「兩側」，但站內嘅指示牌推介使用由A3出口到達，但到達嘅其實係建築喺愛民廣場上面其中四座，要到達沿公主道興建嘅五座樓宇實際上應該利用B2出口到達，亦同樣造成不便。 何文田站轉車 有見及此，港鐵喺站裏面張貼通告指示去何文田邨及愛民邨嘅乘客可以喺B2出口附近搭小巴綫8M。 港鐵屯馬綫於昨日（27日）全綫開通，惟第二日何文田站附近有架空電纜設備故障，導致列車服務受到阻延，需額外行車時間。 事發後《香港01》記者前往何文田站了解，期間一度有數十名乘客需由4號月台前往3號月台轉車，有職員在場提供協助；港鐵亦派出接駁巴士在何文田忠考街接載乘客，未見有太大影響。
何文田站轉車: 愛民廣場：最大室內小型賽車場
政府發言人今日（三月十一日）表示，沙中線落成後將接合馬鞍山線、九龍南線和西鐵線，自東至西貫通現有系统，乘客由馬鞍山可直達屯門，中途無需轉車。 由北至南結合的鐵路走廊則沿現時東鐵線伸延過海，日後乘客從羅湖和落馬洲均可直達香港島的心臟地帶亦無需轉車，有效節省交通時間。 觀塘延線為目前港鐵觀塘線的延伸，由油麻地站再額外新增何文田及黃埔兩站，全程2.6公里均為隧道路段。
為慶祝屯馬線通車，港鐵表示將提供車費優惠，由通車日起至2022年1月1日，於土瓜灣站、宋皇臺站、啟德站、顯徑站出入閘的乘客，使用成人八達通每程車費可減1元；其他八達通則減5毫。 城巴機場快線是往來香港國際機場或港珠澳大橋香港口岸最方便及舒適的交通工具。 我們提供多條往來機場或港珠澳大橋香港口岸與市區的路線， 服務覆蓋港九主要區域，乘客安座於全新款式的低地台空調客車內，欣賞沿途壯觀的青馬大橋。
何文田站轉車: 月台類型
在該模式下，建成後港鐵公司將獲批服務經營權營運沙中線，而每年向政府繳付服務經營費。 為避免遇上人潮，旅客在起程之前，應預早計劃行程及透過不同渠道 (例如電台交通消息及運輸署「香港出行易」流動應用程式)了解最新的交通及公共運輸服務情況。 B2層 (抵港大堂)(高度限制2.2米)則設車站停車場，包括上客區及約500個私家車車位供公眾使用。 工程人員有進行調查及維修，初步調查發現，該隧道位置有一個用作穩定架空輸電線的纜索垂下，影響列車駛經該路段，為審慎起見需要調整列車服務。 工程人員已更換該組件，並即晚開始檢查屯馬綫全綫其他同類型組件。
由於2004年的啟德規劃檢討已採用「不填海」為原則，上述延線計劃實際上已不可能興建。 但是於2007年11月8日，行政會議通過新修訂的啟德城中心發展規劃大綱。 港鐵對事件致歉，時任車務總監劉天成承認事件嚴重，並會深入調查事件。 2014年11月29日，荃灣綫茘景站附近因有訊號故障，導致荃灣綫行車較平常多約20分鐘，十約一小時後才恢復正常。 期間港鐵調動車務疏導乘客，觀塘綫有三班往油麻地站方向的列車改以中環站為終點站。 亦只能建於何文田站1號月台的後方，故何文田站與黃埔站之間須為單線雙程行車。