翻新時，頭卡列車原有的黃色車頭會首先移除（部分車卡與整台駕駛控制台一併移除），然後車廂的電子設備均會全被拆走作翻新。 當整節車卡的車廂組件完全移走只剩車身外殼後，工程人員則開始將列車車門之間三節玻璃車窗的第二節車窗位置進行切割工序。 當其中兩節車窗位置移走後，則打通了全新的2號及4號車門位置，而原有的車窗連外殼組件則用作翻新頭等車廂之用。 其後1xx/3xx編號的車卡會裝上全新的玻璃纖維頭幅組件及加裝額外的車門至新打通的車門位置，而5xx/6xx的車卡則會在原本駕駛室的位置裝上一組全新的車卡連接通道纖維組件，形成一節拖卡，方式與4xx一樣。 其後再安裝所有新款式的車廂組件及電子系統後，一節普通等的車頭及車卡則完成整個翻新程序。
中期翻新列车又称中期翻新电动车组，铁路迷称“乌蝇头”；翻新前称为都城嘉慕列车，坊间称为“电气化火车”、“火车”、“黄头”）乃九广铁路公司拥有的直交传动通勤型电动车组。 于1982年投入运营，全部列车由英国都城嘉慕生产，列车数量为29列。 随两铁合并，九广铁路公司通过与地铁有限公司签订的经营权协议，授予香港铁路有限公司于2007年12月2日起继续使用。
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而英國鐵路顧問公司旗下的Tarnsmark公司於1977年11月向政府呈交鐵路續後發展的計劃書，當中建議使用25000V伏特的架空電纜，以推進每3卡一組的列車。 而且可以牽引3至12節車卡；鐵路局只需購置61組列車，而每小時方向有16班列車行駛。 2021年4月22日，一列港鐵中期翻新列車由九龍塘站駛往大圍期間於隧道內撞及一塊指示牌，當時車內載有乘客，消防及救護員亦接報到場，經初步了解後證實車上無人受傷。 消息指，初步懷疑列車撞及一塊鬆脫的限速指示牌，港鐵公司表示會詳細調查事件原因。
2019年11月12日，編組E82/E24列車於上水站停泊期間被投擲燃燒物，當中頭等車卡432被嚴重焚毀。 該車卡被拆出，由E81/E21的原430車卡代替，並於2019年12月更改編號為432。 2019年10月4日，編組E94/E64的頭等車廂（456）在沙田站被汽油彈掟中，車頂著火。 因應港鐵在2009年1月起取消行李托運服務，港鐵在2013年9月起為1系車廂的輪椅預留位增設座位，令座位數目增至47個，企位則減少至275個，載客量跟3系車廂一樣，令更多乘客有座位安坐。 不過，編號E44的其中三卡列車（[]）由於無法併成一組12卡列車，因而未被翻新，成為碩果僅存仍保留原狀的「黃頭」列車。 此抽車長期存放在何東樓車廠內，九鐵曾在2002年7月27日假沙田貨場舉辦「東鐵列車懷舊之旅 － 慈善藝墟歡樂日」，公開展出該抽列車供參加者參觀。
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2009年7月，港鐵開始更換列車廣播的格式，東鐵綫首先更換並投入服務的是中期翻新列車E24（北行），新的廣播格式與前地鐵網絡列車的廣播格式看齊。 同年底起，列車前往旺角東、九龍塘、大學或羅湖時，改為播放「請小心空隙，及留意月台與車廂地面的高低」。 在列車編組方面，所有列車均統一為6卡一組，編組可隨意以每6卡為一組調動（6卡編組可參見車組排序一節），全列列車亦統一為共12卡，列車的電力裝置也改為6卡為一組（集電弓及摩打除外），如果其中一組發生動力故障，屬於另一組的6卡仍可令列車行駛。
2022年3月30日：臨近此型號全面退役，有人於網上投稿不滿鐵路迷拍攝，惹起網上討論，詳見香港網絡大典相關條目。 本列車的牽引設備4台GEC型225千瓦框架式電動機；同時設有氣壓懸掛系統及隔音設備，使乘客感到舒適寧靜。 由於新列車採用Trainguard MT CBTC訊號系統，而新舊列車將有一段時間並存，故中期翻新列車亦會更新相關設備。
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為應付1990年代客量的增長，九鐵於1988年增購96卡列車，總值7億港元。 而與都城嘉慕簽訂的合約中亦訂明九鐵可以增購次批共42卡；其中首批54卡共9組6卡電動列車（編號E87-E104）於同年以3億6千萬元購入，其後在1989年以3億5千元再增購次批42卡共7組6卡列車（編號E105-E118）。 當時九廣鐵路指出增購列車原因是之前訂購的25組3卡列車的載客量將於1990年初飽和，而作出有關決定。 此型號列車原定於九廣鐵路（英段）主綫以及和合石支綫上行走，翻新前列車牌布亦有「和合石」一格；不過由於該支綫客量太少，將之電氣化並不合乎成本效益[註 1]，故此當主綫在1983年全綫電氣化後，該支綫便遭停辦，此型號之列車未嘗行走和合石支綫。
於2009年7月，港鐵開始更新車廂廣播格式，首列完成更換的東鐵綫列車為E92/E24，新的廣播格式與前地鐵網絡列車的廣播格式看齊。 九龍南綫通車前約一個星期，所有營運中的東鐵綫列車皆已全數更換報站廣播，唯部分特別廣播則沒有修改。 為了減低列車噪音，港鐵率先在未被翻新的3卡黃頭列車E44試行加裝裙板，其後於2008年開始正式為此款列車安裝。 唯獨動力車卡因為機械熱量問題未能裝上裙板（有兩卡動力車卡2105和2106曾經安裝裙板，但後來已除下）。 因此款列車的車底組件屬較舊的款式，運行時仍會發出較高的熱量，所以此款列車的裙板都加添了散熱孔。
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2021年11月27日，港鐵邀請部分鐵路團體到何東樓車廠參觀E44編組「黃頭」列車，同日港鐵在官方社交網站公開復修期間的樣貌。 2019年11月13日，當日三罷運動第三天期間，一列港鐵中期翻新列車在大學站被示威者大肆破壞，車廂內遺留被打碎的玻璃及燒著的痕蹟，肇事列車其中8個車卡因為車廂被纵火嚴重破爛而報廢。 1999年10月31日，最後一列未改裝列車在入廠翻新前，擔當「第一代電氣化火車榮休之旅」用車，由紅磡站駛至大埔墟站。 1984年11月25日，E45編組在上水站調度時出軌，意外後隨即退役。 1986年，九廣鐵路公司增訂25組3卡列車（編號E62-E86）。 及後，又於1988年及1990年增訂兩批共16組6卡電動列車（編號E87-E118），以配合新界東新市鎮通勤交通發展。
而在同年10月，此列車仍停泊在何東樓車廠北面出入線，但車門已被拆去。 1983年7月15日，大埔墟站至羅湖站的第三期電氣化工程完成，九廣鐵路（英段）全線完成電氣化。 在7月15日晚上開出最後一班本地客運柴油列車後結束服務，翌日起九鐵本地線客運全線以電氣化火車運行。 本款的首批列車於1981年4月12日運抵香港後，當時是在地鐵的九龍灣車廠進行組裝，然後才使用貨櫃車把組裝完成的列車運往九廣鐵路九龍貨場（現紅磡貨場）（當年兩鐵曾協議在九龍塘站建造一臨時聯絡線，以便將列車經修正早期系統隧道運入九鐵，但最後改用上述安排）。 這款由英國都城嘉慕製造的列車是配合九廣鐵路英段電氣化工程而購入的。
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該列列車於當日下午一時從紅磡站開往沙田站，列車到達沙田站後港鐵為中期翻新列車舉行感謝儀式。 該班列車於下午三時正，緩慢駛離沙田站月台，前往何東樓車廠後正式退役，標誌著這款列車在香港40年的服役生涯，正式完滿結束。 2021年6月起，因應港鐵中期翻新列車陸續踏入退役潮，該抽列車在何東樓車廠閒置19年後開始進行復修工程，包括重新安裝駕駛室專用的車門、轉向架和集電弓，並於8月中被拖至車廠南面出入線停泊。 第一及第二批次（E1-E86）的原裝黃頭為三卡車廂（1xx-2xx-3xx），以1M2T形成一組。 而第三批次（E87-E118）為六卡車廂（1xx-2xx-5xx-5xx-2xx-1xx），以2M4T形成。
- 中期翻新列車（MLR）亦會同時退役，港鐵表示，特別送出限量版MLR的扶手環部件，讓對於中期翻新列車有不捨的市民及鐵路迷，可藉此珍藏、留念。
- 2021年6月起，該列車在何東樓車廠開始進行復修工程，包括重新安裝駕駛室專用的車門、轉向架和集電弓，並於8月中被拖至車廠南面出入線停泊。
- 由於問答遊戲採用先到先得形式舉辦，導致遊戲網站中午未開始時已出現網絡大塞車，大量網民無法進入，不少網民到港鐵 Facebook 專頁投訴，情況到40分鐘後才開始改善，但亦有少量網民幸運地在較早時間已進入有關網站。
- ，或稱中期翻新電動列車，鐵路迷稱「烏蠅頭」；翻新前稱為都城嘉慕列車，坊間稱為「電氣化火車」、「火車」、「黃頭」）乃九廣鐵路公司第一款以及香港歷史上第二款通勤型電動列車。
- 港鐵公司特別舉辦中期翻新列車有獎問答遊戲，以感謝列車多年來為大眾服務，參加者更有機會贏得限量版中期翻新列車的扶手環部件。
車頭除改為曲面外，車頭擋風玻璃改為三片及增大面積，配色亦改為銀灰色，故鐵路迷根據其外觀稱之為「烏蠅頭」。 中期翻新列車有獎問答遊戲 每列新车只设有9卡车厢，主要在韩国设计及制造；现时已有8列新车付运到港进行测试。 首列经中期翻新的列车于1997年1月底投入服务，初期采用深蓝色车门和蓝绿色做主调。 不过有乘客联络小组的委员批评“死人蓝”不吉利后，到1998年经翻新的列车转为红色车门和蓝色做主调。 所有列车的中期翻新工程于1999年尾完成，并于2000年1月13日由时任九铁主席杨启彦及阿尔斯通香港区代表共同主持竣工典礼。 惟他們坦言，列車被「肢解」的畫面固然令人惋惜，市民亦必須理解因種種現實條件所限，將每一列退役列車均予以保存是不切實際的想法。
中期翻新列車有獎問答遊戲: 香港文匯網
這款列車（MLR）雖然和現代化列車（M-Train）由同一車廠製造，但除電力規格外，車身設計亦有不同。 例如座位佈置不同，令車門之間的距離及車卡與車卡之間的通道較M-Train窄；車卡長度及高度也不一樣，車窗比一般列車為矮。 2011年為所有列車車門更換門膠，同時所有氣動門改裝為電動門；部分列車車輛在轉向架及機器設備區加裝降噪蓋板以降低列車行駛時所產生的噪聲；同时為所有MLR列車翻新駕駛室。 英國鐵路313型電力動車組為九廣鐵路都城嘉慕近郊型3094 Stock電動列車其中一款設計參考對象。 中期翻新列車有獎問答遊戲 中期翻新列車有獎問答遊戲 有獎問答遊戲連結將於2022年5月3日中午12時在港鐵東鐵綫過海段官方網站公佈，有獎問答遊戲時間將於5月4日香港時間下午5時結束。
九鐵主席田北辰於2006年1月14日表示，管理局將每晚開會，確保東鐵可以安全行駛後才會提供服務，並承諾如再有主要組件或其綑綁的尼龍索帶鬆脫，九鐵將即時決定東鐵全線停駛。 最後，九鐵於2006年1月15日獲政府批准，使東鐵改以人手操作，但東鐵由羅湖到尖東的行車時間會增加1.5分鐘，而早上繁忙時間的班次將由每小時24班減到23班，其後更一度減到每小時21班。 經過深入的徹底調查，九鐵確定列車自動操作系統並非導致出現裂紋的直接因素，並於2006年8月6日獲政府批准，恢復東鐵以自動操作系統運作。 中期翻新列車有獎問答遊戲 由此可見，此列車改為通勤服務後，車底組件承受壓力大大增加，當乘客量不斷上升時，車底組件壓力亦不斷上升，機件問題亦隨之而大大增加。
中期翻新列車有獎問答遊戲: 港鐵中期翻新列車
整項中期翻新工程在1999年12月完成，至此東鐵列車已完全由近郊型變成通勤型；九鐵於2000年1月13日假何東樓車廠舉行「九廣東鐵列車翻新工程竣工典禮」。 中期翻新列車有獎問答遊戲 中期翻新列車有獎問答遊戲 由九廣鐵路公司主席兼行政總裁楊啟彥、阿爾斯通運輸香港有限公司羅柏斯及九廣東鐵副總監李殷泰主禮。 2022年5月3日，港鐵公司宣布東鐵綫MLR「港鐵中期翻新列車」將於5月6日舉行榮休活動，並於活動後正式退役。 同日，港鐵亦在facebook專頁舉辦有獎問答遊戲，首100名答對所有問題的參加者可獲得限量版中期翻新列車扶手環部件乙個。 中期翻新列車（MLR）亦會同時退役，港鐵表示，特別送出限量版MLR的扶手環部件，讓對於中期翻新列車有不捨的市民及鐵路迷，可藉此珍藏、留念。 在活動期間，港鐵公司亦將「翻新列車」安排在沙田站暫作停留，而個別乘客亦帶同由九廣鐵路公司發行的刊物及紀念品到場拍攝，最終該列車在下午三時由沙田站一號月台開出，返回何東樓車廠後正式退役。
由此可见，此列车改为通勤服务后，车底组件承受压力大大增加，当乘客量不断上升时，车底组件压力亦不断上升，机件问题亦随之而大大增加。 这款由英国都城嘉慕制造的列车是配合九广铁路英段电气化工程而购入的。 这款列车在服役初期，由于未有安装为车厢供电的蓄电池，因此在通过两段电缆间的中性区时不能为车厢提供照明。
中期翻新列車有獎問答遊戲: 車廂
列車安排方面，九龍站1號及2號月台開行近郊型火車至沙田、3號月台開行遠郊型火車至大埔墟、4號及5號月台開行柴油火車至羅湖。 这款列车于1996年起进行中期翻新延寿工程，列车外观和车厢内部皆被彻底更新。 翻新工程由收购英国都城嘉慕的法国通用电气-阿尔斯通负责，并由英国Jones Garrard为翻新列车进行工业设计。 经翻新后的车头改为较流线的密封式设计，而原本在车头的逃生门则被取消，改为在车卡两侧安装折叠式的逃生楼梯，由下行方向起的第1、第7和第12节车卡的中门下方均设有折叠式逃生梯。