港鐵公共關係對外事務經理林圓則表示，輕鐵未能安排額外車廂投入服務，意指506綫重返輕鐵無望。 多名屯碼區議員對改動有保留，民協楊智恒表示，港鐵臨時提交文件，而且居民反對的聲音較多，諮詢時間不足，建議在工作小組討論。 此外，民協周啟廉認為措施無效，506綫屬「流水綫」，每個分站的上落客時間較長，認為路線明顯不適合以巴士行走。 曾錦榮亦表示，去年已曾三度提出將506綫改以輕鐵行駛，重申以輕鐵行駛才能解決路面情況擠塞的問題。 這些交通工具去屯門碼頭並不遠，巴士站丶輕鐵站丶小巴站都在碼頭旁邊的公共交通大型車站。 特別班次提供載客服務時，所行經的走綫與正規班次大致相同，惟起點及終點站是正規班次的中途站。 506巴士站 清客後一般經屯門鄉事會路、屯興路、屯門公路、皇珠路、龍門路前往龍門路迴旋處／屯青里迴旋處／屯門車廠等候指令，再次行走非定時特別班次，或返回屯門車廠收車。 使用八達通的乘客，於上車拍卡後一小時內轉乘港鐵重鐵網絡（機場快綫除外）／輕鐵，或於港鐵重鐵網絡（機場快綫除外）出閘／輕鐵出站後一小時內轉乘本綫，本路綫車資可獲減免。 所有港鐵車票（包括但不限於輕鐵車票、港鐵紀念車票及搭十送一車票等；不包括屯門－南昌全日通及指定日子使用的紀念車票），不會獲得免費轉乘優惠。
鑑於本綫在友愛路不設車站，港鐵在2009年中開始研究及使用空載巴士進行測試，以計算本線延長至兆麟時所需要的時間及資源。 其後港鐵於屯門區議會中表示，延長本線須增加兩輛巴士以維持現有班次。 由於當時港鐵巴士數量不足，須永久停辦A73及K16綫以換取足夠巴士數量延長至兆麟苑。 乘客使用八達通卡乘搭本路線，於六十分鐘內於指定車站轉乘港鐵屯馬線或輕鐵，可獲回贈本路線車費；於港鐵屯馬線指定車站出閘或於指定輕鐵車站拍卡出站後六十分鐘內轉乘本路線，可獲免費乘搭本路線。 不過，此路綫以循環形式運作，遇上交通阻塞時容易出現拖卡甚至脫班。 506巴士站 港鐵為疏導往返屯門站的乘客，會在繁忙時間加開特別班次來往屯門站及屯門碼頭，但該等班次經常在常規班次開出後的短時間內開出，無法有效疏導乘客，個別車長更索性飛站。 有見及此，港鐵巴士在2016年提議路綫取消循環運作，並保留特別班次，以穩定沿途各站班次，惟最終不了了之。 2021年，港鐵再次提出把此路綫改為雙向運作，並於2022年2月14日起實施。 另外，原屯門站公共交通交匯處在2010年3月被政府收回，用作發展瓏門，該站搬遷至屯門站近C出口的室內總站，即輕鐵屯門站對面。
506巴士站: 車站一覽
本巴士綫開綫時，車費以輕鐵506綫最高收費訂立，導致本綫車費一直比其他港鐵巴士貴。 本巴士綫是唯一一條不是以K字頭編號的港鐵巴士路綫，港鐵曾計劃2012年8月底改名本綫為K56，因屯門區議會強烈反對（代表此線永久改以巴士行駛），最終暫緩計劃。 2008年9月28日港鐵推出全面學生半價優惠（同時適用於港鐵巴士）後，不少屯門區內學生（包括屯門IVE學生）選擇改乘港鐵巴士上下課，因此令本綫客量進一步上升。
- 鑑於本綫在友愛路不設車站，港鐵在2009年中開始研究及使用空載巴士進行測試，以計算本線延長至兆麟時所需要的時間及資源。
- 2003年10月加設K2P線轉乘優惠，兩程車合共只收取K2P線車費，並在2003年12月配合K51和K52線開辦，分別取代521/521P和A52線，兩線和506線亦有轉乘優惠，只收取一程車費。
- 此綫曾稱作506R，在運作期間常規服務506綫仍會繼續，並收取正常車費。
- 由於西鐵線乘客有增加的情況出現，而屯門西南部如蝴蝶邨、新屯門中心和龍門居居民如需乘搭西鐵，最直接是使用506線往屯門站轉乘，因此繁忙時間此路線經常爆滿，在龍門居可能需要等候多於一班車才能上車。
- 現已停辦的九廣輕鐵506線，連接屯門碼頭和友愛，是輕鐵首條屯門區路線，2002年7月起由港鐵巴士506綫取代，共服務了5,042天。
隨著杯渡路架空路軌工程於2003年完工，本線於2003年9月1日起停止服務，同日起輕鐵505線恢復途經建安站及山景邨三個輕鐵車站。 當時杯渡路不准直接右轉屯門鄉事會路往屯門市中心，巴士路線無可避免需要繞路行駛，故此路線往友愛方向擴展服務範圍至新墟一帶。 最初此路線會上杯渡路天橋再落屯門公路往元朗方向，再經新和里轉入屯門鄉事會路，並在雅都商場和德政圍加設分站，一個月後改為杯渡路左轉屯門鄉事會路，並在聖公會聖西門呂明才中學加設分站，再經河傍街掉頭返回雅都商場。 2004年4月4日起，為配合屯門站公共運輸交匯處啟用，本綫改經屯門站公共運輸交匯處，然後前往屯門市中心，取消屯門遊樂場及雅都花園分站。 506巴士站 同日全面改用八達通卡轉乘港鐵、輕鐵及港鐵巴士，不再發售巴士轉乘車票。 屯門支綫（屯門碼頭經豐景園至安定）興建期間，當時所有經市中心站輕鐵路綫均不停安定站2號月台，改以友愛站月台第2卡為北行總站。 另因屯門站巴士總站搬遷，由2010年3月14日起，往兆麟方向改由杯渡路直接右轉屯門鄉事會路，不經河傍街及仁政街，同時不再駛入屯門站巴士總站。 不過，由富健花園開出的特別班次，則由2022年3月4日起，因COVID-19第五波疫情導致太多港鐵職員染疫或被視為密切接觸者而未能執勤，導致巴士車長人手不足而暫停服務。
506巴士站: 友愛邨
輕鐵為配合西鐵屯門站的建安段架空工程，在2002年7月14日開始封閉建安站，輕鐵506線全線需要暫停服務，並由臨時巴士506線取代。 由於九鐵需要同時為山景段提供臨時巴士505線，而九鐵巴士車隊再沒有足夠的後備車隊應付兩條新路線，故向城巴租用八輛利蘭奧林比安型空調巴士，一輛12米版本，七輛11米版本(K111-K117)(詳情可按此)行走兩條臨時路線。 和505線不同之處，是506線全線以空調巴士行走，但當時友愛路不准12米巴士駛入，故此K105最初不會在506線行走，另七輛11米版本巴士會和505線共用，間中會使用丹尼士三叉戟( )行走。
1990年代初，美樂花園及新屯門中心大量居民入住，本綫成為該兩屋苑往市中心的主要路綫。 1990年代末，2個位於散石灣的大型屋苑——龍門居及富健花園相繼入伙，龍門站客量急速上升，由於本綫是唯一前往市中心的路綫，故屋苑入伙進一步帶動本綫的客量。 短程特別車用車主要為丹尼士三叉戟（6XX及7XX）、亞歷山大丹尼士Enviro 500 MMC及富豪B9TL( ) 。 特別車出車並沒有特別規定需用指定一種類型，純粹留起空車有需要時（不定時）開出。 506巴士站 2012年第三季，因港鐵巴士車隊購入新雙層巴士（E400及E500）取代退役單層巴士（富豪B10M），故上午非定時特別班次改以雙層巴士行駛。 2010年9月1日起：港鐵接駁巴士部調派2部車輛至港鐵巴士部門，本綫班次加密至4/5-10分鐘一班。 值得一提，自從各輕鐵接駁巴士路線更改路線編號後，本路線是目前所有港鐵巴士中，唯一一條不以K字頭為編號的路線。
本路線以輕鐵行走時，由於來往屯門碼頭至友愛及安定的走線，較輕鐵507線（取道兆麟苑、豐景園往來）迂迴，加上服務區域較小，後期香港工業北移導致使用建安站人流不斷下降，因此客量只屬一般至偏低水平，用車數目更是當時各輕鐵路線中最少的（只有4至6列，並以單卡營運）。 改由巴士行駛後，由於駛經屯門新墟以及屯門站一帶，加上九廣西鐵通車，客量開始穩步上揚。 加上本路線駛經香港專業教育學院（屯門分校），繁忙時間有不少居住在市區的IVE學生乘搭屯馬線轉乘本路線上下課，而居住屯門西南部的居民，大部份是到屯門站轉乘港鐵來往元朗區及市區上班上學，因此上下午繁忙時間兩邊方向都滿載乘客。 506巴士站 2008年9月28日，港鐵推出學生半價優惠（同時適用於港鐵巴士）後，不少屯門區內學生選擇改乘港鐵巴士上下課，令本路線客量進一步上升。 港鐵巴士506綫由港鐵巴士營運，是一條替代輕鐵的巴士路綫，循環來往屯門碼頭至兆麟之間，主要為屯門碼頭及龍門路（蝴蝶邨至龍門居的一段）沿線居民提供接駁屯馬綫及到屯門市中心的服務。 由於西鐵線乘客有增加的情況出現，而屯門西南部如蝴蝶邨、新屯門中心和龍門居居民如需乘搭西鐵，最直接是使用506線往屯門站轉乘，因此繁忙時間此路線經常爆滿，在龍門居可能需要等候多於一班車才能上車。
現已停辦的九廣輕鐵506線，連接屯門碼頭和友愛，是輕鐵首條屯門區路線，2002年7月起由港鐵巴士506綫取代，共服務了5,042天。 香港特別行政區政府運輸署，〈港鐵巴士第506號線（屯門碼頭—兆麟）改以非循環線方式營運 （页面存档备份，存于互联网档案馆）〉［交通通告］，2022年2月8日。 506巴士站 2009年8月16日今屬屯馬綫的九龍南綫通車，乘搭該綫的吸引力大增，令本綫乘客量再創高峰，而輕鐵的新車輛亦於同年抵港並陸續投入服務，但港鐵初步只把該批列車用於加強現時輕鐵路綫的服務上，同時替代翻新輕鐵時的車輛空缺。
根據運輸署《服務詳情表》，此路線共需使用14輛空調雙層巴士提供服務。 轉乘巴士第一程巴士路綫第二程巴士路綫節省金額建議轉車站506K51／K52第二程免費兩條路綫任何重疊之巴士站K51／K52506備註：轉乘時限為1小時，於首程拍卡起計算。 在特定節日，例如聖誕節、元旦日、農曆新年及中秋節，港鐵各行車綫會通宵行駛，而506綫或會延長服務時間，詳情參閱乘客通告。 2017年5月8日：一輛行走此路綫的列車（編號：1029）在天一商城對開近輕鐵天悅站時，與一輛往元朗西方向的港鐵巴士K73綫丹尼士三叉戟（617／JU6729）相撞，至少22人傷。 此改動會使輕鐵三聖站一帶的乘客，不能再使用506線前往屯門站。 不過，該站乘客可以繼續選乘K52前往，或是前往三聖輕鐵站乘搭505線。 自2021年11月下旬起，輕鐵505線改為平日全線使用拖卡行走，據說是為了配合506線的新安排，但兆麟街路面未能配合，使506線的改動延遲實行。 2003年8月31日，輕鐵建安段架空工程完成，輕鐵505線改回原有行車路線，並於一天後取消505巴士線。
星期六、日及公眾假期不設服務非定時特別班次本綫於繁忙時間，亦設有特別班次，不定期及不定時（官方沒有公佈資料、沒有明文規定及由當日職員以對講機通知開出）有空車於指定車站開始載客，以接載積聚良久仍不能登上正規班次之短程乘客。 因此，有乘客表示看到排隊人龍長、且有特別車出現，就代表將會很大機會因班次失準而導致行程遲到。 506巴士站 2002年8月31日，為減少車程時間及方便屯門南居民來往新墟，本綫改由屯門鄉事會路經青賢街折返，並加設仁政街車站，然後前往屯門市中心。
港鐵 MTR 506 (屯門碼頭 Tuen Mun Ferry Pier) 乘車費用約為 $4.90。 有關 港鐵 MTR 票費的更多信息，請查看 Moovit 應用程序或該機構的官方網站。 2009年6月25日：凌晨零時許，一輛往屯門碼頭方向的丹尼士三叉戟（6XX）駛至屯門湖翠路近美樂花園交界燈位，撞倒一名突然從車頭行出過路的男子，傷者送院後傷重不治。 旺賢街, 石排頭路, 鳴琴路, 杯渡路, 青山公路, 海榮路, 屯門鄉事會路, 杯渡路, 鳴琴路, 石排頭路及旺賢街. 財務委員會審核二零一九至二零年度開支預算管制人員的答覆（局長：運輸及房屋局局長第 9 節會議），立法會，第196頁。 2005年4月8日：一輛行走此路綫的列車（編號：1075）在天秀路路面交匯處與一輛九巴相撞，意外導致巴士司機及4名列車乘客受傷。 506巴士站 2011年12月中：星期日及公眾假期最後一列單卡用車改以拖卡行駛（車序：141），同時晚間班次全以拖卡行走，這代表日間和晚間再沒有單卡班次。 2010年8月底：取消星期一至六下繁、星期六日間所有單卡班次，同時取消星期一至五下繁的145單卡與751P的190車務調動，假日大部分班次改以拖卡服務（車序141除外）。 2010年7月或之前：星期一至五設有一列單卡行走（日間車序：145；晚間車序：143），星期六則使用兩列單卡（上繁車序：143、145；非繁車序：142、145），而假日更主要以單卡服務（車序：141、143、145）。 餘下的六輛新巴富豪奧林比安在2004年12月全數退還給新巴。
甄霈霖同提到，兆麟街的兆麟站為單線單程行車，質疑在雙層巴士停泊後，會有交通意外的風險，建議港鐵「擺三架巴士」作實地測試。 港鐵巴士506綫目前為循環綫，往來屯門碼頭至兆麟站，港鐵建議改為雙向總站。 港鐵經理（巴士員士及行車）盧俊豪稱，506綫較後段分站的班次受早段的交通影響而不穩，遂計劃以兆麟街的兆麟站為506總站，令目前不穩的路段，即兆麟至屯門碼頭路段避免受影響。 唔要西鐵,你話你住豐景園,那我建議你坐507或614輕鐵去市中心. 劇劇…西鐵可以免費轉506,K51,K52多條西鐵接駁巴士.市中心去碼頭/龍門居行過去??? 2012年7月，運輸署曾表示港鐵計劃於2012年8月底將此路綫之編號由506改為K56， 506巴士站 以統一港鐵巴士各綫號碼，並避免乘客將之誤解為輕鐵路綫。 但此計劃遭區議員一致反對，認為號碼一旦更改，即代表506將永久以巴士行駛，違背當初506會回復以輕鐵行駛之承諾。 最終港鐵擱置有關更改編號的計劃，而運輸署則指會繼續和港鐵商討506的長遠安排。 本綫亦駛經香港專業教育學院屯門分校（IVE屯門分校），繁忙時間有不少居住在市區的IVE學生乘搭屯馬綫再轉乘本綫上下課，而居住屯門西南部的居民，大部份是到屯門站轉乘港鐵來往元朗區或市區上班上學，因此上下午繁忙時間兩邊方向都滿載乘客。 2009年10月12日起，本綫延長至兆麟，不再繞經友愛路，並改經海榮路、青山公路和兆麟街，加設輕鐵三聖站及兆麟站。
506巴士站: 港鐵 Mtr
506線由港鐵接手營運初期，仍然以兩款丹尼士三叉戟作主力用車。 1991年10月，507線延長至屯門碼頭，以及1992年2月開辦614線，來往屯門碼頭和屯門市中心一帶，乘搭507或614線會較506線直接，因此屯門碼頭客某程度上會流失。 列車编组1卡編組或2卡編組运营信息開通營運1989年4月17日廢除年份1995年擁有者九廣鐵路公司營運者九廣鐵路公司本線回廠路綫，走路綫與506相同。 惟本綫列車接載乘客至進入輕鐵車廠前最後一個輕鐵車站後便停止服務返回輕鐵車廠，約在1995年停止提供服務。 此線是唯一條由屯門碼頭至建安再行走至友愛的路線，在屯門東支線開通前一向使用拖卡來運行，自從614開通和507延伸至屯門碼頭，客量大減而大量消減拖卡運行。 停辨前，此線除車務調動外以6輛單卡行走，與506D共用列車。